口袋妖怪火红大厦通关核心是拿到钥匙卡解锁电子门，利用传送阵穿梭楼层，逐层击败火箭队成员，最终抵达11层击败坂木救出社长完成通关。进入大厦前需要完成紫苑镇精灵塔剧情，拿到茶水解除金黄市入口守卫阻拦，才能正常进入大厦内部，大厦内部一共有11层，遍布火箭队训练家、传送地砖与大量上锁电子门，盲目踩踏传送地砖很容易陷入循环迷路，提前备好足量药剂、状态恢复道具，精灵队伍等级尽量维持在35至40级区间，配置水系、草系、超能系宝可梦，应对毒系、地面系对手会更加顺畅。

进入大厦一楼大厅之后，直接搭乘电梯前往5楼，在楼层靠下的走廊位置击败火箭队成员，战斗结束后获取关键道具钥匙卡，这是开启大厦全部电子门禁的必需品，没有钥匙卡大部分房间都无法进入，不要提前乱踩传送地砖，避免被随机传送到其他楼层打乱推进节奏。拿到钥匙卡之后返回3楼，使用钥匙卡打开上锁房门，清理房间内的火箭队小兵，踩下房间内的传送地砖跳转至7楼，7楼会触发和劲敌的对战，劲敌宝可梦综合实力较强，打完之后和旁边NPC对话，可以领取一只乘龙，这只宝可梦水系输出能力优秀，后续对抗坂木的地面系宝可梦可以派上用场。大厦9楼右下角房间存在恢复床位，连续多场战斗之后可以过来免费恢复宝可梦血量与PP，不用反复往返宝可梦中心，大幅提升探索效率。

借助楼层之间的传送阵和电梯继续向上推进，沿途可以选择性清理剩余火箭队训练家，击败之后能够获取经验、金钱以及各类技能机器，5楼可以拿到TM01爆裂拳，7楼可以拾取TM08巨大化，各个房间角落还散落着神奇糖果、各类药剂等实用道具，部分被电子门封闭的房间，拿到钥匙卡之后都可以回头搜刮。对战火箭队杂兵时，对方多使用毒系宝可梦，超能系招式可以打出不错的克制伤害，部分小兵会使用自爆、毒系状态技能，需要常备解异常的道具，尽量避免宝可梦被中毒消耗血量，遇到打不过的对手可以选择绕道，优先保障主线推进，通关之后再回头补全剩余战斗和道具收集。

一路推进抵达11楼社长办公室，就会触发和坂木的BOSS对战，坂木主力以地面系、岩石系宝可梦为主，包含尼多后、铁甲犀牛、大岩蛇，水系、草系招式能够有效克制这套阵容，岩石属性会抵消草系招式伤害，对战时需要及时切换宝可梦，不要用草系招式硬打岩石类宝可梦。击败坂木之后所有火箭队成员会全部撤离大厦，不用再清理剩下的小兵，和被困的大厦社长对话，就能拿到游戏内稀有道具大师球，大师球可以百分百捕获任意宝可梦，建议留存用来抓捕稀有神兽，完成对话之后大厦主线剧情正式结束，后续可以自由返回大厦，把之前遗漏的道具全部收集完毕。